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La collection minéralogique contient plus de 20 000 spécimens du monde entier, parmi lesquels les premières collections de Sir William Dawson, d’A.F. Holmes (1797-1850), qui a fondé la faculté de médecine de ³ÉÈËVRÊÓƵ, et de B.J. Harrington (1848-1907), premier chargé de cours en minéralogie de ³ÉÈËVRÊÓƵ, puis professeur de chimie et de métallurgie. En 1913, le musée acquiert l’extraordinaire collection de minéraux du géologue et ingénieur des mines Walter F. Ferrier (1865-1950). Au fil des ans, cette collection s’est enrichie grâce à plusieurs donations. Des minéraux provenant du monde entier sont exposés à la galerie Hodgson. La galerie Dawson présente la diversité minérale du Québec, notamment des minéraux de localités mondialement réputées telles que la mine Jeffrey à Asbestos, le mont Saint-Hilaire et la carrière Francon à Montréal. Ces deux derniers sites abritent des minéraux rares, parmi lesquels la weloganite, la dresserite, la donnayite et la hilairite, que l’on ne trouve que dans très peu de localités.