scCoAnnotate est un flux de travail Snakemake qui g茅n猫re, par rapport 脿 une r茅f茅rence, un consensus de pr茅diction de types cellulaires 脿 l鈥檃ide de donn茅es de s茅quen莽age d鈥橝RN 脿 l鈥櫭ヽhelle de la cellule (scRNA-seq). Con莽u par le , ce flux de travail est utilis茅 pour ex茅cuter plusieurs outils d鈥檃nnotation afin de pr茅dire les types cellulaires associ茅s 脿 diff茅rents 茅chantillons de scARN-seq. Cet outil regroupe plusieurs mod猫les statistiques et approches d鈥檃pprentissage automatique dans le domaine de la biologie unicellulaire. En combinant les forces de ces mod猫les, il g茅n猫re un consensus des pr茅dictions dont la pr茅cision sup茅rieure a 茅t茅 d茅montr茅e par des exp茅riences d鈥櫭﹖alonnage. Le flux de travail automatis茅 est convivial et ne n茅cessite pas de connaissances en apprentissage automatique. Les utilisateurs peuvent 茅galement le parall茅liser pour exploiter leurs ressources computationnelles au maximum de leur efficacit茅.
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